Forskare i zoologisk beräkningspaleogenomik

Zoologiska institutionen är en av institutionerna vid Naturvetenskapliga fakulteten och har cirka 50 anställda och 40 doktorander. De huvudsakliga forskningsområdena är ekologi, etologi, funktionell morfologi, systematik och evolution, samt populationsgenetik. Mer information om oss finns på: Zoologiska institutionen. Centrum för paleogenetik (CPG) är ett forskningscentrum med världsledande faciliteter och expertis för att generera och analysera förhistoriska DNA-data. CPG består av sju forskningsgrupper och c. 45 doktorander/postdoktorer/anställda, och finansieras gemensamt av Naturhistoriska riksmuseet samt institutioner inom Geovetenskaper, Zoologi och Arkeologi vid Stockholms universitet. Mer information om oss finns på: Centre for Palaeogenetics. Projektbeskrivning Zoologiska institutionen inbjuder till ansökningar för en forskaranställning vid Centrum för paleogenetik (CPG) i Stockholm. Inriktningen på den planerade forskningen syftar till att utveckla banbrytande paleogenomiska beräkningsmetoder för analys av kraftigt degraderat DNA. Detta inkluderar utvecklande av metoder för noggrann mappning och autentisering av extremt korta och skadade DNA-fragment, att utveckla verktyg för iterativ mappning mot divergenta referensgenom, samt validering av prestanda hos beräkningsgenmiska verktyg med hjälp av simulerade och empiriska data. Forskningsprojektet och de verktyg som utvecklas finansieras av och kommer att användas inom pågående forskningsprojekt om interaktioner mellan människor, djur och patogener (KAW First Contact & ERC MAMBA), biodiversitetsdynamik (ERC PoC ECOGEN) samt strukturella varianters dynamik över tid (Formas). Arbetsuppgifter Huvudsakligen forskning inom paleogenomisk beräkningsgenomik, men upprättande och administration av beräkningskluster och lagringsdatabaser som behövs för dessa analyser, samt deltagande i den dagliga verksamheten vid Centrum för paleogenetik. Behörighetskrav En forskare anställs i huvudsak för forskning och ska ha avlagt doktorsexamen eller har en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Bedömningsgrunder Vid tillsättningen kommer särskild vikt att fästas vid vetenskaplig skicklighet inom paleogenomisk beräkningsgenomik. Kunskaper inom datorprogrammering, samt erfarenhet från utveckling av bioinformatiska programvaror, Nextflow pipelines för paleogenomisk forskning, analys av exceptionellt gammalt och/eller nedbrutet DNA är meriterande. Eftersom forskaren förväntas samarbeta med postdoktorer och doktorander vid Centrum för paleogenetik så är det även en merit om forskaren har egen erfarenhet av laborativt arbete på förhistoriskt DNA. Om anställningen Anställningen avser heltid och gäller tills vidare med sex månaders provanställning. Tillträde enligt överenskommelse. Vi erbjuder Hos oss får du dynamiken i samspelet mellan högre utbildning och forskning som gör Stockholms universitet till en spännande och kreativ miljö. Du arbetar i en internationell miljö och får förmånliga villkor. Universitetet ligger beläget i Nationalstadsparken med goda förbindelser till city. Stockholms universitet värnar om att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika rättigheter och möjligheter för alla. Kontakt Upplysningar om anställningen lämnas av professor Love Dalén, love.dalen@zoologi.su.se. Ansökan Du söker anställningen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Bifoga personligt brev och CV samt de bilagor som efterfrågas i ansökningsformuläret. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag. Anvisningar för sökande finns på webbsidan: att söka en anställning. Stockholms universitet bidrar till det hållbara demokratiska samhällets utveckling genom kunskap, upplysning och sanningssökande.